Les missions de la fédération s'articulent autour de troix axes principaux.

Premièrement, la FEDIUT dispose d’un réseau de formateurs qui dispense de nombreuses formations destinées aux associatifs de son réseau. Nous dispensons des formations à plusieurs occasions dans l'année lors des JEF (Journée de Formation) ou les WEF (Week-end de Formation) organisés par nos administrateurs. Cela permet à chaque BDE et fédération IUT d'avoir les clés nécessaires pour mener à bien leur mandat associatif.

La FEDIUT est aussi engagée pour les étudiants qu'elle représente. Elle agit au plus près des IUT en formant et en aidant à mettre en place des listes d’élus universitaires dans le but de représenter les étudiants d’IUT au sein des différents conseils d’université (Conseil d’IUT, CA, CFVU, …).

Enfin, nous avons pour volonté de pouvoir travailler avec et pour les étudiants d’IUT de France, c'est pourquoi, la FEDIUT est administrée par des associations IUT qui participent activement à la vie de la fédération. Réunir les étudiants d'IUT d'une même zone géographique permet de développer les relations entres IUT et permet aux associations de collaborer ensemble.